訴にした。佐川氏は嫌疑不十分。決裁文書の改ざんは財務省理財局が近畿財務局に指示し、１４の決裁文書から学園との交渉経過を削除。佐川氏の国会答弁との整合性を取るために書き換えたとされるが、特捜部は改ざん前後で「文書の根幹部分は変わっていない」ことから不起訴とした。学園との交渉記録を意図的に廃棄した公用文

問を行った。佐川氏は改竄について、首相官邸の指示・関与を否定した。「最強官庁」が前代未聞の暴挙に手を染めるに至った一因として、「官邸ｖｓ財務省」の確執を指摘する向きもある。「官邸に報告することなく、財務省理財局の中で行った」佐川氏は証人喚問で、こう語った。東大卒、財務省ナンバー２まで上り詰めた、自負